Mapa de São Vicente de 1502
O nome São Vicente foi dado por Américo Vespúcio, em 22 de janeiro de 1502, em viagem que objetivava mapear o litoral do novo continente. Quando passou por essa região, viu duas ilhas, Goiaó e Guaibê (onde hoje estão Santos e Guarujá) e o estuário, que achou ser um rio. Era dia de São Vicente, assim tendo sido batizada a localidade, mas não fundada.
Segundo muitos historiadores, teria sido o português Cosme Fernandes Pessoa, conhecido como Bacharel de Cananéia, degredado do governo português, o verdadeiro fundador de São Vicente, a partir de onde de fato governava e controlava o comércio da região. Segundo documento encontrado pelo historiador português Jaime Cortesão (1884-1960), o Bacharel já moraria na América antes até da chegada de Cabral: O degredado é citado em um documento datado de 24 de Abril de 1499, descoberto por Cortesão, o qual reporta-se a uma viagem não-oficial de Bartolomeu Dias ao novo continente, que o trouxe e foi deixado nessa localidade. Cosme Fernandes Pessoa foi acusado junto ao Rei de Portugal, por dois amigos seus, que em troca receberam doações em terras, de manter relações com os espanhóis que viviam mais ao sul, com perigo para o domínio português na região. Para tanto, a coroa portuguesa enviou Martim Afonso de Sousa (1490/1550-1571) Para estabelecer oficialmente a colonização do novo continente, confirmando o poder da coroa e retirar o poder de Cosme Fernandes Pessoa, que por sua vez, avisado antecipadamente incendiou o local e retirou-se com seu pessoal para Cananéia. ( Daí vem o nome Bacharel de Cananéia).
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